Unibertsitateko institutuak ikerketa sustatzeko eta Fakultateetako goi mailako zikloen berezko espezializaziora, jakintza arlo jakin bat hobetzera edo lanbide gaikuntza berezi batera bideratutako irakaskuntza jardueretarako sortutako zentroak dira.
Gaur egun, bederatzi institutu ditugu fakultate batean integratuta edo unibertsitateari atxikita zuzenean, eta/edo Deusto Fundazioaren bitartez.
Deustuko Unibertsitatean bederatzi katedra ditugu fakultate ezberdinetan. Katedrei esker, zubia sor daiteke unibertsitatearen eta enpresen eta erakundeen artean, intereseko arloetan prestakuntza eskaintzeko, ikertzeko eta ezagutza transferitzeko.