Ikerketa da unibertsitate institutuen helburu nagusia. Giza Eskubideen Institutuaren ikerketa programaren bidez, giza eskubideen egungo erronken azterketa eta ezagutza zabaldu nahi da ikerketa proiektu eta kontratuen bidez, baldin eta horien emaitzak berrikuntza garrantzitsuak badira gizarte eta lege zientzientzat, eta giza eskubideak betetzeaz arduratzen diren eragile politiko eta sozialentzat baliagarriak badira.
Ikerketak eta haren zabalkundeak, bai eta horrekin sortutako ezagutzaren transferentziak ere, lagundu egin behar dute erakundearen ingurune sozial eta politikoetan, tokikotik nazioarteraino, giza eskubideen kultura finkatzen.